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中國(guó)科學(xué)家首次破譯牡丹基因組 三項(xiàng)成果世界領(lǐng)先

作者:東昌府新聞網(wǎng) 發(fā)表于:2017-09-27 10:50:10  點(diǎn)擊:


26日,洛陽農(nóng)林科學(xué)院和深圳華大基因農(nóng)業(yè)控股有限公司共同召開新聞發(fā)布會(huì)宣布,中國(guó)科學(xué)家在世界上首次成功破譯牡丹基因組,填補(bǔ)了芍藥科植物基因組研究空白。

據(jù)深圳華大農(nóng)業(yè)應(yīng)用研究院院長(zhǎng)董揚(yáng)介紹,牡丹基因組的破譯,在國(guó)際植物基因組研究上填補(bǔ)了芍藥科植物基因組的空白,在牡丹研究方面具有里程碑意義。

董揚(yáng)說,此次破譯取得了三項(xiàng)世界領(lǐng)先。首次完成了牡丹基因組精細(xì)圖的繪制,使“數(shù)字化牡丹”精彩呈現(xiàn)。完成牡丹基因組組裝大小12.25GB,拼接片段Contigs N50=128KB,基因組完整度98%,雙端比對(duì)率98.8%,錨定染色體85%的基因組精細(xì)圖譜,實(shí)現(xiàn)了超大基因組三代測(cè)序技術(shù)的完美組裝。

首次注釋了65898個(gè)牡丹基因,使“定制化牡丹”成為可能。獲取了包含牡丹花形、花色控制基因及與牡丹籽油合成相關(guān)的基因,為精準(zhǔn)化牡丹分子育種提供了技術(shù)支撐。

首次構(gòu)建了牡丹基因組及表型數(shù)據(jù)庫(kù),使“信息化牡丹”觸手可及。依托研究成果建設(shè)了牡丹基因組數(shù)據(jù)庫(kù),涵蓋1000余份牡丹品種資源,從基因視野對(duì)牡丹進(jìn)行分類、甄別,實(shí)現(xiàn)大數(shù)據(jù)查詢應(yīng)用。

據(jù)介紹,基于此項(xiàng)研究成果,可以更加科學(xué)地做好牡丹品種資源的溯源、保護(hù)工作,可以實(shí)現(xiàn)牡丹精準(zhǔn)定向分子育種,可以加快牡丹產(chǎn)業(yè)化發(fā)展。

據(jù)了解,牡丹基因組極其復(fù)雜,達(dá)12.5GB(約是人類基因組的4.5倍)。2014年12月,洛陽市政府、深圳華大基因簽署協(xié)議,共同開展洛陽牡丹基因組學(xué)研究。雙方經(jīng)過近三年的協(xié)作攻關(guān),動(dòng)用了包括國(guó)家銀河超算在內(nèi)的各種科研資源,應(yīng)用世界最先進(jìn)的第三代測(cè)序技術(shù),在世界上首次破譯了牡丹基因組。

來源:新華社